Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHMP5Q9NZZ3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHMP5Q9NZZ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CHMP5Q9NZZ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms