Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDND1Q9NY35 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDND1Q9NY35 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDND1Q9NY35 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDND1Q9NY35 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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