Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM260Q9NX78 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM260Q9NX78 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM260Q9NX78 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms