Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC28Q9NX36 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAJC28Q9NX36 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAJC28Q9NX36 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms