Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLN6Q9NWW5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN6Q9NWW5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN6Q9NWW5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms