Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PAK1IP1Q9NWT1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAK1IP1Q9NWT1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms