Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBCCD1Q9NVR7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TBCCD1Q9NVR7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TBCCD1Q9NVR7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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