Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDFIP2Q9NV92 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NDFIP2Q9NV92 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDFIP2Q9NV92 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDFIP2Q9NV92 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms