Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC39A9Q9NUM3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC39A9Q9NUM3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms