Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KCND1Q9NSA2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCND1Q9NSA2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms