Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NDUFA4L2Q9NRX3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NDUFA4L2Q9NRX3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms