Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC42SE2Q9NRR3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42SE2Q9NRR3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.2 ms