Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
DUOX2Q9NRD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
DUOX2Q9NRD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
DUOX2Q9NRD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
DUOX2Q9NRD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
DUOX2Q9NRD8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms