Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4ENIF1Q9NRA8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EIF4ENIF1Q9NRA8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms