Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPHK2Q9NRA0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPHK2Q9NRA0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPHK2Q9NRA0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms