Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PFDN4Q9NQP4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN4Q9NQP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PFDN4Q9NQP4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms