Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCUBE2Q9NQ36 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCUBE2Q9NQ36 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms