Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED4Q9NPJ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED4Q9NPJ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED4Q9NPJ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED4Q9NPJ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED4Q9NPJ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED4Q9NPJ6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms