Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NGRNQ9NPE2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NGRNQ9NPE2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NGRNQ9NPE2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms