Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNB1IP1Q9NPC3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNB1IP1Q9NPC3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNB1IP1Q9NPC3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms