Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PNPLA8Q9NP80 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PNPLA8Q9NP80 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PNPLA8Q9NP80 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms