Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD248Q9HCU0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CD248Q9HCU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD248Q9HCU0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms