Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC28A3Q9HAS3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC28A3Q9HAS3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC28A3Q9HAS3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC28A3Q9HAS3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC28A3Q9HAS3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC28A3Q9HAS3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC28A3Q9HAS3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC28A3Q9HAS3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC28A3Q9HAS3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC28A3Q9HAS3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC28A3Q9HAS3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms