Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EBF2Q9HAK2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF2Q9HAK2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EBF2Q9HAK2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF2Q9HAK2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms