Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCSER2Q9H7U1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCSER2Q9H7U1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCSER2Q9H7U1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCSER2Q9H7U1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
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