Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMYD3Q9H7B4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMYD3Q9H7B4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMYD3Q9H7B4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms