Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRDM12Q9H4Q4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms