Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRN3Q9H3W5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRN3Q9H3W5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms