Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PDCL3Q9H2J4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDCL3Q9H2J4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms