Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB6CQ9H0N0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB6CQ9H0N0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB6CQ9H0N0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms