Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.512e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 RPS6KA2-209ENST00000507371 759 ntTSL 315.89■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 RPS6KA2-207ENST00000506565 587 ntTSL 412.28□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 RPS6KA2-206ENST00000503859 4137 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 RPS6KA2-213ENST00000512860 552 ntTSL 47.65□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 PANK4-212ENST00000515423 430 ntTSL 311.89□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.237e-12■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 LARP1-210ENST00000519931 569 ntTSL 46.83□□□□□ -1.325e-9■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC9-211ENST00000521700 548 ntTSL 316.76■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 AC124319.1-201ENST00000576808 653 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.543e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 THRA-205ENST00000577288 581 ntTSL 423.77■■□□□ 1.46e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 THRA-208ENST00000578218 907 ntTSL 423.72■■□□□ 1.396e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 THRA-210ENST00000585047 574 ntTSL 423.26■■□□□ 1.316e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.276e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.156e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 PLPBP-202ENST00000518036 558 ntTSL 420.62■□□□□ 0.896e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 PLPBP-206ENST00000523187 569 ntTSL 318.63■□□□□ 0.576e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 PLPBP-209ENST00000523994 559 ntTSL 318.42■□□□□ 0.546e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 PLPBP-207ENST00000523358 516 ntTSL 218.26■□□□□ 0.516e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 PLPBP-203ENST00000520073 770 ntTSL 217.35■□□□□ 0.376e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 EMP3-209ENST00000599704 753 ntTSL 313.84□□□□□ -0.196e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.26e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.76e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 MIR4713HG-201ENST00000559909 561 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 LONP2-206ENST00000565867 1969 ntTSL 38.77□□□□□ -1.016e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.026e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 USP12-202ENST00000612674 712 ntTSL 27.3□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 PLPBP-208ENST00000523521 384 ntTSL 35.32□□□□□ -1.566e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 LONP2-204ENST00000564259 819 ntTSL 35.24□□□□□ -1.576e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.076e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 RABL6-209ENST00000466096 3949 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.196e-8■■■■■ 27.4
CSTF2TQ9H0L4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.27■□□□□ 0.682e-22■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 LAMTOR4-208ENST00000474831 564 ntTSL 312.9□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.443e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF581-204ENST00000588537 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.663e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 LAMTOR4-212ENST00000494136 427 ntTSL 27.94□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 218.52■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 417.72■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 FOXRED1-214ENST00000532590 674 ntTSL 25.77□□□□□ -1.496e-8■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 RNF213-207ENST00000559070 4644 ntTSL 1 (best)10.74□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 27.3
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC9-215ENST00000524162 591 ntTSL 419.49■□□□□ 0.711e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 315.04■□□□□ -01e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC9-213ENST00000522504 665 ntTSL 314.51□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC9-206ENST00000519482 551 ntTSL 411.74□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 27.2
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CSTF2TQ9H0L4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-8■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 IQSEC2-214ENST00000639796 2351 ntTSL 312.12□□□□□ -0.471e-8■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 IQSEC2-215ENST00000640005 1323 ntTSL 410.72□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 IQSEC2-206ENST00000638521 4501 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.3□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 IQSEC2-209ENST00000638869 3000 ntTSL 59.99□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 LUZP1-204ENST00000471849 1190 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.543e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 ZNF638-204ENST00000410075 3518 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TSC2-221ENST00000568366 767 ntTSL 416.26■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TSC2-213ENST00000483020 563 ntTSL 412.39□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 TSC2-212ENST00000471143 577 ntTSL 411.27□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 ZNF263-206ENST00000574674 691 ntTSL 25.81□□□□□ -1.487e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 ZNF263-207ENST00000575332 2637 ntTSL 34.51□□□□□ -1.697e-7■■■■■ 27.2
CSTF2TQ9H0L4 MAEA-218ENST00000513301 595 ntTSL 415.58■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 MGRN1-208ENST00000587747 1898 ntTSL 515.34■□□□□ 0.053e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 SLC50A1-210ENST00000488609 890 ntTSL 314.98□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 MGRN1-204ENST00000536343 1575 ntTSL 214.78□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 LCN12-209ENST00000484304 545 ntTSL 513.07□□□□□ -0.323e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 513.91□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 NDUFC2-KCTD14-201ENST00000528251 566 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 NDUFC2-KCTD14-204ENST00000614236 386 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.786e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 NDUFC2-203ENST00000527806 1888 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.96e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.956e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.456e-8■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 GYG2-208ENST00000520904 624 ntTSL 319.75■□□□□ 0.754e-9■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-227ENST00000523576 860 ntTSL 313.49□□□□□ -0.259e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.49e-7■■■■■ 27.1
CSTF2TQ9H0L4 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.479e-7■■■■■ 27.1
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