Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZMYND12Q9H0C1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZMYND12Q9H0C1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZMYND12Q9H0C1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZMYND12Q9H0C1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms