Protein–RNA interactions for Protein: Q9H078

CLPB, Caseinolytic peptidase B protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPBQ9H078 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPBQ9H078 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLPBQ9H078 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPBQ9H078 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms