Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2J2Q9GZM3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2J2Q9GZM3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2J2Q9GZM3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms