Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MTMR12Q9C0I1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MTMR12Q9C0I1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTMR12Q9C0I1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms