Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZC3H12CQ9C0D7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZC3H12CQ9C0D7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZC3H12CQ9C0D7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZC3H12CQ9C0D7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms