Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM9Q9C026 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM9Q9C026 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms