Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C1QTNF4Q9BXJ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C1QTNF4Q9BXJ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms