Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLVAPQ9BX97 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLVAPQ9BX97 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLVAPQ9BX97 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLVAPQ9BX97 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLVAPQ9BX97 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLVAPQ9BX97 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms