Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCNM1Q9BWG6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCNM1Q9BWG6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCNM1Q9BWG6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms