Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REPIN1Q9BWE0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REPIN1Q9BWE0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
REPIN1Q9BWE0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms