Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFT27Q9BW83 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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