Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMIM2Q9BVW6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM2Q9BVW6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM2Q9BVW6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms