Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIOK2Q9BVS4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIOK2Q9BVS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIOK2Q9BVS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms