Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KATNB1Q9BVA0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KATNB1Q9BVA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms