Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV94

EDEM2, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM2Q9BV94 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EDEM2Q9BV94 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDEM2Q9BV94 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDEM2Q9BV94 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM2Q9BV94 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM2Q9BV94 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM2Q9BV94 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EDEM2Q9BV94 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM2Q9BV94 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM2Q9BV94 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDEM2Q9BV94 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms