Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBB6Q9BUF5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBB6Q9BUF5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBB6Q9BUF5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms