Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM43Q9BTV4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms