Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PI4K2AQ9BTU6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PI4K2AQ9BTU6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PI4K2AQ9BTU6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms