Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTA3Q9BTC8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTA3Q9BTC8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTA3Q9BTC8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms